Prediction model external validation

OHDSI in Korea
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안녕하십니까. 경희대학교 약학대학 소속 연구원 윤현아라고 합니다.

Atlas를 통해 구축된 Prediction Model의 External validation을 시도하고 있습니다.
연구 중 위의 사진과 같은 오류가 계속 발생하여 어떻게 하면 좋을 지 방법을 찾고 있는 중입니다.
저희 데이터베이스는 Oracle이 아니어서 Null로 지정해놓은 상태입니다.

혹시 비슷한 오류를 해결해보신 분이 있으면 해결 방법 공유 부탁드립니다.

감사합니다.

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사용하시는 DB가 PostgreSQL 일까요?

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Redshift 입니다!!

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output folder에 error log가 있을텐데, 공유 가능할까요?

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네 교수님, output folder에는 log.txt 파일 하나가 생성되었는데,
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R에서 뜨는 것과 같은 것 확인할 수 있었습니다.

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아마도는 package 간의 version이 안 맞을 가능성이 제일 높습니다.

아래처럼 Hydra를 이용해서 package를 re-building 해보시면 어떨까 하는데요…

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추가적으로 Prediction Model의 skeleton이 old version인 것 같습니다. 아래에 공유해드리는 update된 skeleton으로 변경하신 후에 구동해보시는 것을 추천드립니다!

OHDSI/SkeletonPredictionStudy: A skeleton package to use as a template for studies developing prediction models (github.com)