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안녕하세요. 분당서울대병원 김석 연구원입니다.
CDM 프로젝트를 진행하면서 진단코드 매핑을 검토하고 있습니다.
원내에서 사용하고 있는 코드를 기반으로 ICD to SNOMED로 변환하려고 하는데,
CDM에서 제공하는 Relationship 테이블에서 ICD 코드 1개가 여러개의 SNOMED로 매핑되는 것을 확인하였습니다.
OHDSI에서도 아래 링크와 같이 용어체계가 다르기 때문에 어쩔수 없다라고 설명한 것 같습니다.
http://www.ohdsi.org/web/wiki/doku.php?id=documentation:vocabulary:mapping
혹시 1:다 매핑건에 대해서 어떤 방법으로 처리하여 진행할 수 있을지 문의 드립니다.
하나의 진단이 두 개의 SNOMED concept_id로 매핑되는 경우 실제 condition 테이블에는 두개의 condition이 occur한 것으로 데이터가 적재됩니다. 이는 OHDSI 컨소시엄에서 정한 룰 이기 때문에 이에 맞춰서 작업을 하시면 될 것 같습니다.
참고로 현재 아주대에서는 ICD to SNOMED를 차용해서 해결되지 않는 KCD코드에 대해 추가적으로 매핑하였으며, ICD to SNOMED 관계를 이용해 concept_id를 매핑하는 과정에서 일어나는 정보의 손실을 최소화하기 위한 매핑 업그레이드 작업을 진행하고 있습니다.
Hi,
It looks like you are talking about ICD to SNOMED mapping.
My team is actually checking and making these mappings (and we and @Christian_Reich are the authors of these rules
so please ask, if you have a questions.
@DoyeopKim
답변해 주셔서 감사합니다.
@Dymshyts
Thank you for your comments.
If I have any questions, I will contact you.
좋은질문과 답변 감사합니다. 혹시 snome to icd9 or 10 매핑관련 코드를 snomed 로 변환할 수 있는 방법이있을까요? 커뮤니티에 조인한지 얼마되지 않아 배워가고 있어 여쭤봅니다.
This is great, thanks for such great questions and answers. I was wondering if there is a way to map from SNOMED to ICD9 or ICD10? I have just joined the cocmmunity, so am asking around lots of basic questions. Please excuse my simple questions!
concept_relationship table의 'Maps to’를 이용하시면 변환이 가능합니다.
답변 감사드립니다. 혹시 그 테이블은 어디에서 찾을수있는지요? 아테네나 아틀라스에 계속해서 찾아보았는데, 확실히 아직 개념이 잡히지 않아서 여쭤봅니다.
https://github.com/OHDSI/CommonDataModel/wiki/Standardized-Vocabularies 에서 확인하실 수 있습니다.
vocabulary는 http://athena.ohdsi.org/ 에서 다운 받으실 수 있습니다.
답변 정말 감사드립니다!!!