OMOP CDM 구축을 위해 필요한 단계와 단계별 소요예상시간, 필요인력, 참여기관과 지원기관의 역할에 대해 설명하고자 합니다.
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협약
참여기관 필요인력 : CDM 변환 총 책임자 및 실무담당자 -
사전준비
참여기관 필요인력 : CDM 변환 총 책임자 및 실무담당자
참여기관 역할 : 예산, 인력, 장비/설비, 라이센스 준비
지원기관 역할 : 안내/자문, CDM 구축 오리엔테이션 -
용어추출
예상소요시간 : 1주일
참여기관 필요인력 : EMR 관리자 1인 (DB전문가)
참여기관 역할 : 약품, 치료재료, 처치의 EDI코드(기관코드) 처방빈도순 추출 및 지원기관 전달
지원기관 역할 : 안내/자문 -
용어매핑
예상소요시간 : 지원기관 용어 커스터마이징 2개월, 참여기관 기관자체코드 매핑 3개월 (type concept ID만 매핑시: 1주일)
참여기관 필요인력 : 의료인 2인 (의무기록사, 간호사, 의사)
참여기관 역할 : 지원기관에서 제공하는 EDI 코드 매핑 외에 기관 자체코드(선택사항)와 type concept ID 매핑
지원기관 역할 : 빈도 99%에 해당하는 EDI코드와 국제표준코드 매핑결과 제공 (필요시 추가코드 커스터마이징) -
ETL정의
예상소요시간 : 2개월
참여기관 필요인력 : 2인 이상 (EMR 관리자, 의료인)
참여기관 역할 : 변환 테이블과 데이터 범위 정의 및 ETL 정의서 작성
지원기관 역할 : 안내/자문 -
ETL수행
예상소요시간 : 1개월 이상
참여기관 필요인력 : 1인 이상 (DB 전문가)
참여기관 역할 : ETL 변환 쿼리 작성(SQL) 및 실행
지원기관 역할 : 안내/자문 -
Tool 적용
예상소요시간 : 1개월 이상
참여기관 필요인력 : 1인 이상 (R/JAVA 전문가)
참여기관 역할 : Achilles, Atlas 등의 OHDSI 도구 설치
지원기관 역할 : 안내/자문, 필요시 원격 또는 방문 지원 -
DQM/평가
예상소요시간 : 1개월 이상
참여기관 필요인력 :2인 이상 (DB 전문가, 의료인)
참여기관 역할 : 지원기관에서 제공하는 양식과 절차에 따라 DQM 및 평가 보고서 작성 및 지원기관 제출
지원기관 역할 : DQM/평가 양식 제공 및 절차 안내 및 결과 피드백 -
공동연구 예상소요시간 : 연구에 따라 상이함
참여기관 필요인력 : R 사용자 1인(데이터파트너로써 참여시), 주도적 연구시 자체 구성
참여기관 역할 : 주도적으로 공동연구 기획/진행 또는 외부 연구에 참여분석
지원기관 역할 : 공동수행
- 3+4단계와 5단계는 동시진행됨 , 5, 6 단계는 ETL 수행 완료 시까지 반복 진행
