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모든 종류의 cancer를 포함시켜 concept set을 만들고자 하는데, 'cancer confirmed(id: 4194405)'에 descendents 포함시키면 원하는 결과를 얻을 수 있을까요?
저 id로 입력했을 때 제외되는 암이 없는지 궁금합니다.
그리고, pneumonia(id: 255848) 역시 모든 종류의 pneumonia가 포함된 개념인가요?
community-acquired pneumonia(id: 4293463), hospital-acquired pneumonia(id: 4143092) 등이 모두 포함된 개념인지 궁금합니다.
안녕하세요, 최근 OHDSI Korea 게시판의 사용이 저조해 져서 답변이 늦었습니다 죄송합니다.
선생님께서 생각하시는 모든 컨셉이 정답이 될 수는 있지만, 일반적으로 OHDSI에서 사용하는 cancer 관련의 concept set에는 다음과 같은 concept의 하위 컨셉으로 구성할 수 있을 것이라고 생각합니다:
| ID | CODE | NAME | CLASS | CONCEPT | VALIDITY | DOMAIN | VOCAB |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 443392 | 363346000 | Malignant neoplastic disease | Disorder | Standard | Valid | Condition | SNOMED |
단, 해당 컨셉에는 primary malignant neoplasm만 포함된 것이 아니기 때문에, 일부 컨셉들은 exclude 해야 할 것 같습니다.
말씀하신 pneumonia 컨셉이 CAP를 하위로 가지고 있기 때문에, 써도 될 것 같습니다.
전반적으로 OMOP voca의 hierarchy를 공부해 보시면 더 잘 이해가 될 것 같습니다. 추천 강의입니다: https://www.youtube.com/watch?v=1-FF8xkg0xs&list=PLpzbqK7kvfeVzlAXenD6iWhRxWvmlfdHN
감사합니다.