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[공지] Save Our Sisyphus in Korea Challenge

OHDSI in Korea
#1

연구 설계에서부터 연구의 출판까지 험난한 과정은 언덕 위로 바위를 굴리는 시지푸스의 고난과 같이 험난하고 어려운 과제로 보일 수 있습니다. 단일 기관 연구가 아닌 다기관 연구일 경우 데이터 수집 및 가공, 분석 등의 각 단계별로 다양한 권한과 기술을 필요하여, 개인 연구자에게는 그 과제가 불가능에 가까울 때가 많습니다. OHDSI가 호메로스가 노래한 오디세우스의 위대한 여정에서 그 이름을 가져온 것도, 훌륭한 의학적 근거를 만드는 작업이 이러한 여정에 비견될 정도로 고되기 때문입니다.

한국 OHDSI 네트워크는 매 연구마다 반복되는 이러한 험난한 과정을 공동의 힘으로 극복하기 위하여 2017년 3월 조직되었습니다. 그리고 이제 우리는 첫 공동 연구 및 논문 출판을 위하여 훌륭한 연구 주제를 가지고 있는 연구자를 찾는 Save Our Sysiphus in Korea Challenge (SOS KOREA CHALLENGE)를 시작합니다. 이번 첫 challenge는 후향적 코호트 비교연구로 population-level effect estimation study이라 할 수 있습니다. 한국 OHDSI 네트워크는 OHDSI가 수립한 오픈소스 툴과 프로세스를 활용하여 연구 진행 및 논문 작성의 모든 단계를 지원할 것입니다. 적절한 연구 프로토콜을 설계하고, 네트워크 분석 패키지를 구현하며, SOS challenge supporter 기관을 통해 분석 패키지를 실행하고, 출판을 위해 원고를 함께 준비할 것입니다.

한국 OHDSI 네트워크는 아직 미숙한 신생아와 같습니다. 이번 SOS KOREA challenge 를 통하여 기관별 데이터 변환, 질 관리, 기관간 데이터 비교, 다기관 연구 수행을 위한 핫라인 구성까지 공동 연구의 전반의 프로세스를 점검하여, 우리가 세상 위에 두 발로 설 수 있음을 증명할 것입니다. 그리고 곧이어 다양한 구성원들이 걷고, 뛰는 법을 익혀 국내외의 다양한 여정에 자유롭게 참여할 수 있게 될 것이라 믿습니다.

이번 challenge 에는 2005년부터 2015년까지 약 700만명의 환자 데이터를 가지고 있는 4개 대학 병원이 supporter로써 도움을 줄 예정입니다. 분석 대상으로 기본적인 인구학적 데이터 및 진단 / 투약 및 시술 수행 기록이 포함됩니다. 연구는 OHDSI Best practice for estimating population-level effect에 따라 수행될 예정입니다.

연구자는 병원 기록의 장/단점을 고려하여 OHDSI framework를 통해 연구 주제를 다음과 같이 표현해주시기 바랍니다.
To compare the risk of [insert outcome here] between [insert target cohort here] and [insert comparator cohort here], we will estimate the population-level effect of exposure on the [insert relative risk metric] of the outcome during [insert time-at-risk here].
예제는 하기와 같습니다.

  1. To compare the risk of incident ischemic stroke, observed in inpatient setting between dabigatran new users with prior atrial fibrillation and warfarin new users with prior atrial fibrillation, we will estimate the population-level effect of exposure on the hazards of the outcome during the period from 1 days from cohort start date to 0 days from cohort end date.
  2. To compare the risk of upper gastrointestinal complication (UGIC) events between celecoxib new users and diclofenac new users, we will estimate the population-level effect of exposure on the rate of the outcome during the period from 0 days from cohort start date to 0 days from cohort end date.

연구 주제는 링크를 통해 11월 18일까지 제출해주시기 바랍니다.

연구 주제 및 연구자 선정 결과는 2017년 11월 28일 발표할 예정입니다. 연구 주제 선정 시, 매주 또는 격주 단위로 연구 아이디어를 한국 OHDSI 멤버들과 하는 원격 회의를 통해 투명하게 공유하고, 국제 OHDSI meeting 에서도 연구 주제 및 중간 결과 공유를 부탁드립니다. 많은 참여 부탁드립니다. 감사합니다.

#2

안녕하세요 가천 길병원 최윤이 입니다 .
SOS challenge 의 연구주제 제출 기한 마감이 언제일지요?

항상 감사합니다.

#3

@cys7like 제가 기한을 깜빡했네요. 11월 18일까지 받을 계획입니다. 감사합니다 ^^

#4

감사합니다^^

Daum 메일앱에서 보냈습니다.

#5

안녕하세요 가천 길 병원 최윤이 입니다.

이미 제출한 연구 주제의 경우 확인이 되지 않아 수정할 방법을 못찾고 있습니다.
제출한 연구주제를 수정할 수 있는 방법이 있을지요?

#6

@cys7like, 선생님, 다시 한 번 더 제출해주시면, 수정한 것으로 감안하여 보도록 하겠습니다. 감사합니다. ^^

#7

감사합니다. ^^

#8

다양한 주제를 다양한 변수로 변주하여 여러가지를 제출하였는데

(1인당 여러 주제를 제출해도 상관 없을지요?)

다시 제출하는 것이 혼동을 드릴 수 도 있을 것 같아

수정본을 다시 제출하지는 않겠습니다.

바쁘신 중에 답변 주셔서 감사합니다.^^

#9

총 37개의 연구주제를 접수하였습니다.
뜨거운 성원에 감사 드립니다 ^^

#10

예상보다 많은 분들이 참여해주셔서 감사 드립니다.
현재 박래웅 교수님(@rwpark) 께서 research question 하나하나를 검토 중이신데, 연구 주제마다 literature review 및 feasibility check를 위한 pilot code 수행 때문에, 예정보다 발표가 다소 늦어질 것 같습니다.
늦어도, 12월 5일까지는 발표하실 예정으로 발표시에 모든 발표자분들의 이메일로 선정된 주제에 대해 다시 공지드리도록 하겠습니다.

다시 한 번 늦어져서 죄송합니다.

아주대 의료정보학과 유승찬 드림

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#11

안녕하세요,

먼저 이번 제 1회 SOS in Korea challenge 에 많은 관심 기울여주신 여러 기관의 선생님들께 감사의 말씀을 전하고 싶습니다. 이번 challenge 에는 저희의 기대를 훨씬 뛰어넘는, 총 37 가지의 연구 주제가 접수 되어, 예정보다 발표가 늦어지게 되었습니다.

많은 선생님들의 경험과 독창성, 그리고 노고를 느낄 수 있는 연구 주제들 중에서 단 하나의 주제만을 선정하기 너무 어려워, 고심 끝에 하기의 연구 주제 2가지를 선정하였습니다.
12월 12일부터 매주 또는 격주로 tele-conference를 통해 하기의 연구를 진행하려 합니다. tele-conference는 모두에게 개방되어 있으니, 많이 참여하셔서 연구 노하우를 공유하여 주시면 좋겠습니다 (시작 전 다시 한 번 tele-conference link를 보내드리도록 하겠습니다).

아직 Korean OHDSI network는 시작 단계로 부족한 면이 많지만, 금번 1st SOS challenge 가 국내외적으로 많이 발전할 수 있는 기회라고 믿습니다.
많은 선생님들의 성원에 다시 한 번 감사드립니다. 1st SOS challenge 의 research가 종결된 후, 다시 2nd SOS challenge를 계획하고 있습니다. 이 때에도 많은 관심 부탁 드립니다.

  1. Hip or femoral fracture risk between Tenofovir vs. Entecavir
    -가천대 길병원 최윤이 선생님
    A. Background: Tenofovir and entecavir are the treatment of choices for chronic hepatitis B patients. Whereas tenofovir exposure has been associated with decreased bone density, it remains unclear whether it is associated with increased risk of fractures. So, we will conduct study head to head comparison between tenofovir and entecavir on the risk of fracture event.
    B. Target Cohort: The patient with Tenofovir
    C. Comparator Cohort: The patient with Entecavir
    D. Outcome: The event of fracture risk ( hip or femoral )
    E. Relative risk metrics: Cox proportional hazard

  2. Renal toxicity risk between NSAIDs and COX-2 inhibitors
    -강원대 병원 박지인 선생님
    A. Background: Although it is evidence that non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) can cause acute kidney injury, the risk for renal dysfunction of cyclooxygenase-2 (COX-2) inhibitors is controversial. The aim of this study is to compare the risk of acute kidney injury between COX-2 inhibitor and conventional NSAIDs in the large population.
    B. Target Cohort: Cyclooxygenase-2 (COX-2) inhibitor users
    C. Comparator Cohort: Conventional nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) users
    D. Outcome: Emergency department admission or admission due to acute kidney injury
    E. Relative risk metrics: Cox proportional hazard

아주대학교 박래웅 배상

#12

SOS research tele-conference는 12월 13일부터, 매주 수요일 오후 6시에 시작될 예정입니다.
많은 선생님들께서 함께 참석하여, 연구 노하우를 공유할 수 있으면 좋을 듯 합니다 .

WebExlink를 이용하여 연결하시면 됩니다 .감사합니다.

아주대학교 의료정보학과 박사과정 유승찬 드림

#13

금주 SOS challenge 원격회의는 원광대학교 ATLAS tutorial과 겹치게 되어 12월 21일 (목) 오후 5시에 하기로 하였습니다.
해당시간에 하기 링크를 통해 참석하실 수 있습니다. 많은 참여 부탁드립니다 ^^

https://abmi.webex.com/abmi-en/j.php?MTID=m41d5eda094e5e1ae3578f984487b8af6

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