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각 cdm의 차이점에 대한 질문입니다


(Micheal Jeong) #1

안녕하세요. CDM에 대해서 공부를 하고 있는 학생입니다.
우선 국외 자료가 아닌 국내 자료로써, OHDSI in Korea가 포럼으로 열려있어서 참만 다행이라고 생각하며, 각 종 좋은 메터리얼을 올려주시는 아주대 의료정보학과 출신 박사님들과 그 외 연구원님들에게 감사말씀을 드립니다.
다름이 아니라, CDM 공부하면서 OMOP-CDM이 가장 보편적으로 쓰고 있는 건 알겠는데 왜 OMOP-CDM이 가장전 세계에서 일반적으로 쓰이는 것일까? 단지, 테이블 갯수가 많고, 제공하는 컬럼의 수가 많아서 일까? 라는 생각이 들었습니다. 말고도, K-CDM, 미니 센티넬, 피코르넷 등등 말고도 CDM이 종류가 많은데 OMOP-CDM만 쓰는 또 다른 이유들이라도 있나요? 그리고 다른 CDM들이 비교적으로 단점이 있다면 말씀 부탁드리겠습니다.


(Rae Woong Park) #2

OMOP-CDM은 모든 CDM의 mother격이라고 보시면 되겠습니다. Sentinel CDM이나 POCRNET도 모두 OMOP을 근간으로 해서 발전해 오고 있습니다.
OMOP과 달리 Sentinel CDM이나 POCRNET은 표준용어를 가지고 있지 않습니다. 따라서 미국을 제외한 국외에서 활용하기에 제한이 많습니다.
오딧세이는 비영리 국제 학술단체이며 전세계 누구에나 열려있습니다. 이에 비해 Sentinel CDM은 미국 FDA와 계약을 맺은 일부 기관만 참여할 수 있는 폐쇄망입니다. POCRNET은 미국내에서만 운영되고 있습니다.
K-CDM은 백서가 공개된 바가 없어서 실체를 정확히 모르겠습니다.
오딧세이는 아래와 같이 미션과, 비전, 목표에서 제시하였으며
https://www.ohdsi.org/who-we-are/mission-vision-values/
그 정신을 충실하게 이행하기 위하여 모든 것들을 투명하게 공개하고 있으며, 상호 협력하에 발전시켜나가고 있습니다.
Innovation: Observational research is a field which will benefit greatly from disruptive thinking. We actively seek and encourage fresh methodological approaches in our work.

Reproducibility: Accurate, reproducible, and well-calibrated evidence is necessary for health improvement.

Community: Everyone is welcome to actively participate in OHDSI, whether you are a patient, a health professional, a researcher, or someone who simply believes in our cause.

Collaboration: We work collectively to prioritize and address the real world needs of our community’s participants.

Openness: We strive to make all our community’s proceeds open and publicly accessible, including the methods, tools and the evidence that we generate.

Beneficence: We seek to protect the rights of individuals and organizations within our community at all times.


(Micheal Jeong) #3

궁금했던 점이 풀린 것 같아서 좀 더 CDM과 표준용어에 대한 개념을 이해할 수 있을 것 같습니다 감사합니다.


(Micheal Jeong) #4

궁금했던 점이 풀린 것 같아서 좀 더 CDM과 표준용어에 대한 개념을 이해할 수 있을 것 같습니다 감사합니다.

Blockquote


(Rae Woong Park) #5

추가로 정보를 좀 더 드리면, 아래 내용은 어느 논문에서 찾아서 정리한 것인데, 원 소스는 못 찾겠네요.

•Observational Medical Outcomes Project (OMOP) CDM: Foundation of the NIH - most comprehensive, most granular, standard vocabulary, non-profit, international

•MS-CDM: FDA- focused on adverse event, no cost

•PCORnet CDM: MS-CDM: no vocabular, coarse

•HL7 RIM, CDISC BRIDG: never used for storage and/or analysis

•Virtual Data Warehouse (VDW): HMO Research Network- Distributed data warehouse to allow comparative studies across collaborating sites

•i2b2 : Partners Healthcare - Scalable informatics framework to investigate disease of genetic origin


(Micheal Jeong) #6

아 각각의 CDM과 표준기구에 대한 특징이 나와 있네요. i2b2는 저한테 생소해서 무엇인지에 대해 좀 더 찾아보도록 하겠습니다. 자세하게 설명해주셔서 감사합니다.


(Rae Woong Park) #7

Sentinel CDM, PCORnet, OMOP, CDISC SDTM간 비교한 논문이 있습니다. 참고하세요.

Evaluating common data models for use with a longitudinal community registry


(Micheal Jeong) #8

아 자료 올려주셔서 감사합니다.


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